EAF填补 在gwas数据获取当中,有许多数据并未含有eaf值,这对后续的分析极为不利。 EAF值: 如何进行EAF值的填补 参考文章:https://cloud.tencent.com/developer/article/2327202 我采取了以下两种方法 snp_add_eaf函数 snp_add_eaf
TwoSampleMR包迎来了0.6.0版本 之前在opengwas中网站就看到消息,5月1号之后需要使用opengwas的api token才可以获取到他们的gwas数据了。 昨天对包进行更新时,发现版本已经变成了0.6.0版本。现在通常使用的 extract_instruments 函数多了一个参数: 说明如下: opengwas_jwt:Us…
SMR简介以及代码实操 一、简介 SMR是由西湖大学杨健教授团队开发并支持的一个进行SMR以及HEIDI检验的软件工具。其官方网址是SMR,其中包含了对SMR的详细介绍以及操作教程。 SMR(Summary data-based Mendelian Randomization analysis),其核心思想就是利用eQTL数据对某些phenotyp…
在edge中的new bing 边栏辅助功能 边栏里面的new bing 已经开放使用了,前提是科学上网哦。科学上网的具体操作,这里就不放了。 辅助阅读的具体操作 first step 科学上网 second step 打开自己需要看的文献,目前发现pdf(大小不能太大,譬如内科学,外科学...),普通的网页也可 third step 点开边栏的n…
工作区 这个功能之前在上面就推送过,但是不知道具体的使用方法 今天在看文献的时候,突然遇到一个问题,当我点开很多标签页的时候,我的电脑的电量不够了,同时手里的文献还没有看完 比如: 这样 这个时候,我发现了工作区的使用方法 点击左上角的工作区标志 选择“+”,即可以创建新的工作区,此处我已经创建了两个新的 此时,点击旁边的三个点的符号,可以选择将当…
写一个python 学习笔记? 计算机组成原理简述 计算机构成 内存 硬盘 CPU(寄存) 终端命令操作 切换路径 cd+路径跨盘符切换 输入后 + 盘符: dir查看路径下的文件与文件夹 编译与解释 编译型语言 输入内容编译器机器码电脑 特点:一次编译,多次运行 编辑器 解释型语言输入内容解释器编译器电脑 环境配置 安装网址:python 官方网…
目的:利用爬取的疾病的数据,完成数据的相关处理 方法: GWAS cFDR 参考文献:[使用多效性cFDR方法改进对冠状动脉疾病和血压常见变异的检测](使用多效性cFDR方法改进对冠状动脉疾病和血压常见变异的检测 |科学报告 (nature.com)) 条件错误发现率(cFDR),只需要相关性状/疾病的独立GWAS数据集的汇总统计结果。基于遗传多效…
这篇文章没有摘要