目的：利用爬取的疾病的数据，完成数据的相关处理

方法：

• GWAS cFDR
• 参考文献：[使用多效性cFDR方法改进对冠状动脉疾病和血压常见变异的检测](使用多效性cFDR方法改进对冠状动脉疾病和血压常见变异的检测 |科学报告 (nature.com))
• 条件错误发现率（cFDR)，只需要相关性状/疾病的独立GWAS数据集的汇总统计结果。基于遗传多效性，通过合并两个GWAS数据集，将大大提高遗传位点的统计能力和识别能力。

相关函数

package

• data.table 数据读取

setwd()

• 设置路径需要提前创建一个存在的路径

fread()

• 读取大文件
• 用法：xx <- fread("xx/xx/xx.txt", header = ?,)

names()

ls()

显示当前已有的所有遍历

rm()

清空变量

• rm(list=ls()) 清空当前所有变量

merge（）

• 合并两个数据框的数据,在于在两个不同的数据框中标识共同的列或行。
• 用法：merge(x, y, by=xxx, all=?)

问题

• Winkler/GCST010723_buildGRCh37.tsv 该路径下文件不存在
• library(GWAScFDR)该package无法导入
• 报错：A version of this package for your version of R might be avai7ab1e elsewhere
  1. 处理措施：library(BiocManager) 结果：没有帮助
  2. 解决办法：从GitHub上导入GWAScFDR包，指令：
  install.packages("devtools") devtools::install_github("KehaoWu/GWAScFDR")
  • devtools 已经安装后可以忽略此行
  • GWAScFDR 为集成的包，其中包括：RColorBrewer ggplot2 等